クラウドがゲノム解析に不可欠な理由 - DIGITALIST

　前回はユーザエクスペリエンス（UX）の視点から、そもそもクラウドとは何か、医療分野での活用のメリットは何かについて解説した。今回は、実際にクラウドが、がんのゲノム医療実現にどのように関わっているか見ていこう。

　がんのゲノム医療とは、個々の患者のがん細胞の全ゲノムデータを読んで、ゲノム中の変化（バリアント）を知り、それに最も適した薬を選んで治療する医療のこと。そして、約30億個といわれる塩基配列を含む膨大なデータの解析を行うのが、シークエンサー（遺伝子を読む装置）である。

　このシークエンサーでシェアナンバーワンの企業が、米国のイルミナ社だ。このイルミナ社の解析スペースサービスBaseSpace Sequence Hub^1）は、クラウドであるAmazon Web Service（AWS）上で行われている。ゲノムの場合、データ量が数GBから数十GBになることが多いため、クラウドにデータを置いて解析をすることが望ましく、クラウドを用いた事例が海外では多く報告されている。例えば、Microsoft Genomics ^2）、 Google Cloudを利用したゲノム解析^3）、 AWSを利用したがんゲノムのクラウドThe Cancer Genomics Cloud （CGC）^4）など。シークエンサーから直接クラウドに接続しているケースも少なくない。

1）BaseSpace Sequence Hub（Illumina）
2）Microsoft Genomics（Microsoft Azure）
3）Cloud Life Sciences（Google Cloud）
4）Cancer Genomics Cloud （CGC）

　解析・保存すべきゲノムのデータ量が巨大になっていくことについては、2015年の記事であるが、『Nature』という有名な論文誌のNews欄にて ^5）、2025年までには100万人から2億人のヒトゲノムが読まれて、2〜40エクサバイトのストレージが必要になるだろうと予測されている。ギガバイトの1000倍がテラバイト、その1000倍がペタバイト、その1000倍がエクサバイトである。YouTubeの動画のストレージが2025年に1〜2エクサバイト必要になると予想されていることと比べてみても、ゲノムのデータサイズは蓄積されると非常に大きいことが分かる。

5）NATURE NEWS 07 July 2015

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